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萊氏無膽甾原體PCR 檢測試劑盒使用方法

點擊次數:780 發布時間:2020/4/10
提 供 商: 上海一研生物科技有限公司 資料大小:
圖片類型: 下載次數: 144 次
資料類型: OCX 瀏覽次數: 780 次
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萊氏無膽甾原體PCR 檢測試劑盒說明書

1、 試劑盒簡介

 流行性造血器官壞死病,是由無囊膜胞漿型虹彩病毒科蛙病毒屬的流行性造血器官壞死病毒

(EHNV)所引起的魚類疾病。病魚因肝臟、脾臟、腎臟造血組織和其他組織壞死而導致死亡。易感動物主要為赤鱸、虹鱒等種類,其中,赤鱸對該病毒極為敏感,幼魚和成魚都可受 EHNV 感染。EHNV 屬于虹彩病毒科蛙病毒屬(除新加坡石斑魚虹彩病毒之外)病毒,本公司針對蛙病毒屬的流行性造血器官壞死病毒( epizootic haematopoietic necrosis virus, EHNV)等病毒的主衣殼蛋白( MCP) 基因序列,開發了本試劑盒。應用本試劑盒進行檢測具有快速、靈敏、特異、準確 、安全、操作簡單、應用廣泛等特點及優點。

2、 試劑盒組成

試劑盒組成包括核酸提取試劑和核酸擴增試劑,具體組成參見表 1:

表 1:試劑盒組成(50test/盒)

試劑盒組成成分 體積

核酸提取試劑: 樣品 DNA 提取液 1

樣品 DNA 提取液 2 5ml×1 管

500µl×1 管

核酸擴增試劑: DEPC 水

EHNV 熒光 PCR 反應液

Taq 酶(5U/ul) 陰性對照

EHNV 熒光陽性對照 5ml×1 管

750µl×1 管

40µl×1 管

1ml×1 管

1ml×1 管

*保存條件:樣品 DNA 提取液 1、2 和試劑盒須在-20℃保存。

3、 樣本采集,存放及運輸

樣本采集

采集活的或瀕死的魚的腎或脾等組織,研磨PBS稀釋后提取核酸。或將細胞培養分離病毒的有CPE 的細胞懸液提取核酸病毒。

存放

研磨后的樣本在 2 ℃—8 ℃條件下保存應不超過 24 h;-70 ℃以下可長期保存,但應避免反復凍融(多凍融 3 次)。

運輸

萊氏無膽甾原體PCR 檢測試劑盒采用冰或泡沫箱加冰密封進行運輸。

4、 檢測步驟

DNA 核酸提取操作方法(在樣本處理區進行):

取 n 個 1.5ml 滅菌 Eppendorf 管,其中 n 為待檢樣品數、一管陽性對照和一管陰性對照之和, 對每個管進行編號標記。

每管加入 100 µl DNA 提取液 1,然后分別加入待測樣本、陰性對照和陽性對照(陽性對照吸取前充分混勻)各 100µl,一份樣本換用一個吸頭;混勻器上震蕩混勻 5 s,于 4℃~25℃條件下, 12 000 r/min 離心 10 min。

盡可能吸棄上清且不碰沉淀,再加入 10µl DNA 提取液 2,混勻器上震蕩混勻 5s,于 4℃~25℃ 條件下,2 000 r/min 離心 10 s。

100℃ 干浴或沸水浴 10 min;加入 90µl DEPC 水,12 000 r/min 離心 10 min,吸取上清, 即為提取的 DNA,冰上保存待用(提取的 DNA 需在 2 h 內進行 PCR 擴增或放置于-70℃冰箱內保存)。

熒光 PCR 檢測

擴增試劑準備(在反應混合物配制區進行):

從試劑盒中取出熒光 PCR 反應液、Taq 酶,2000×g 離心 5 秒鐘。每個樣品測試反應體系配制見下表 2。

表 2 每個樣品測試反應體系配制表

試劑 熒光 PCR 反應液 Taq 酶 合計

用量 14.5 μL 0.5μL 15μL

加樣(樣本處理區進行):

向每個PCR 管中各分裝15μL 的混合液,再分別加入樣本DNA 模板10μL,蓋緊管蓋,500 r/min

離心 30 s。

熒光 PCR 檢測(在檢測區進行): 循環條件設置:

一階段,94 oC /4 min;

第二階段,95oC/15 s,60 oC/60 s; 40個循環;在每次循環的60 oC退火延伸時收集熒光。試驗檢測結束后,根據收集的熒光曲線和Ct值判定結果。

5、 結果判定

結果分析條件設定

直接讀取檢測結果。閾值設定原則根據儀器噪聲情況進行調整,以閾值線剛好超過正常陰性樣品擴增曲線的高點為準。

質控標準

5.2.1陰性對照無Ct值或無擴增曲線。

5.2.2陽性對照的Ct值應<28.0,并出現典型的擴增曲線。否則,此次實驗視為無效。

萊氏無膽甾原體PCR 檢測試劑盒結果描述及判定

5.3.1陰性

無Ct值或無擴增曲線,示樣品中無EHNV核酸。

5.3.2陽性

Ct值≤30,且出現典型的擴增曲線,示樣品中存在EHNV核酸。為進一步確診是EHNV,建議用普通PCR進行確認或測序。

5.4 有效原則

Ct>30的樣本建議重做。重做結果無數值者為陰性,否則為陽性。

6、 相關技術信息

MCP-153F: 5’-TCACCAAGCTGCCGTCTCT-3’ MCP-215R:5’-AAAACTGCTGCCCGAAAGC-3’

MCP-175T: (FAM)5’-CGCCAAGATGTCGGGCAACCC-3’(TAMR

 
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